Tout au long de son histoire, les conflits ont façonné diverses doctrines au sein de l'Église catholique romaine. L'Église contemporaine est confrontée à des controverses liées au racisme, au genre, aux droits reproductifs, aux abus sexuels, aux abus de pouvoir, aux relations homosexuelles et aux conflits intra- et interreligieux. Dans ces situations, les responsables ecclésiastiques peuvent recourir à différentes stratégies pour gérer les conflits, notamment la négociation, le dialogue ou la répression. Souvent, ces stratégies présupposent des schémas d'interprétation d'unité et de stabilité ou perçoivent le conflit de manière restrictive, comme une simple « opposition publique au magistère »

Ce qui se produit souvent peut être comparé à ce que Thania Paffenholz, du Centre sur les conflits, le développement et la consolidation de la paix de l'Institut de hautes études internationales et du développement de Genève, appelle la gestion des conflits : cette approche des dirigeants est largement diplomatique et descendante, exclut les populations à la base et ne s'attaque pas aux racines profondes du conflit.