Gennem sin historie har konflikter formet forskellige doktriner i den romersk-katolske kirke. Den moderne kirke kæmper med kontroverser om racisme, køn, reproduktive rettigheder, seksuelt misbrug, magtmisbrug, forhold mellem personer af samme køn og konflikter inden for/interreligiøse. I disse situationer kan kirkeledere anvende forskellige strategier til at håndtere konflikter, herunder forhandling, dialog eller undertrykkelse. Ofte forudsætter sådanne strategier fortolkningsmønstre af enhed og stabilitet eller opfatter snævert konflikt blot som "offentlig modstand mod læreembedet"

Det, der ofte sker, kan sammenlignes med det, Thania Paffenholz fra Center for Konflikt, Udvikling og Fredsopbygning ved Graduate Institute i Genève omtaler som konflikthåndtering: denne tilgang fra ledernes side er i høj grad diplomatisk og topstyret, ekskluderer folk på græsrodsniveau og går ikke dybt ned i konfliktens rødder.